Kelasta voi hakea korvausta lääkärin määräämistä lääkkeistä. Sairauden mukaan määräytyviä korvausluokkia on kolme: peruskorvaus, alempi erityiskorvaus ja ylempi erityiskorvaus. IBD kuuluu alempaan erityiskorvausluokkaan. Lääkekulujen korvaamisen edellytyksenä on, että lääkkeelle on vahvistettu korvattavuus ja kohtuullinen tukkuhinta lääkkeiden hintalautakunnassa. IBD:n kohdalla erityiskorvauksen saaminen edellyttää tähystyksessä otettuihin koepaloihin perustuvan erikoislääkärin kirjoittaman B-todistuksen toimittamista Kelaan.
Lääkekuluille on vuosittainen omavastuuraja, jonka ylittävistä lääkekuluista joutuu maksamaan vain 1,5 euron lääkekohtaisen omavastuuosuuden. Apteekki voi seurata maksukaton täyttymistä asiakkaan suostumuksella, jos kaikki lääkeostot keskitetään yhteen apteekkiin. Kun kattokorvausraja on täyttynyt, voi asiakas valtuuttaa apteekin asioimaan suoraan Kelan kanssa. Sairaanhoidon maksukattojärjestelmä on osa sosiaaliturvaa. Vuonna 2008 kunnallisen terveydenhuollon asiakasmaksuissa on 590 euron maksukatto kalenterivuotta kohti. Maksukaton täytyttyä asiakas saa avohoidon palvelut pääsääntöisesti maksutta. Terveyspalvelujen käyttäjän on itse seurattava maksukaton täyttymistä. Seuraamista helpottaa terveyskeskuksista saatava seurantakortti. Alkuperäiset maksukuitit on kuitenkin säilytettävä, sillä ne on esitettävä tarvittaessa ennen kuin asiakas saa todistuksen maksukaton täyttymisestä.
Todistuksen antaa terveyskeskus tai muu julkinen terveydenhuolto. Myös sairauden tutkimuksista ja hoidosta aiheutuneista matkakustannuksista saa korvausta siltä osin kuin ne yhteen suuntaan tehtyä matkaa kohden ylittävät omavastuuosuuden. Kuntoutuksesta aiheutuneet tarpeelliset ja kohtuulliset matkakustannukset korvataan kuntoutujalle kuntoutuslakiin perustuvan kuntoutuspäätöksen nojalla. Sairausvakuutuksen ja Kelan korvaamien kuntoutuksien matkoissa on yhteinen vuotuinen omavastuu. Vuosittaiseen omavastuuseen lasketaan myös omavastuun alle jäävät sairausmatkat.
Sairausvakuutuksen perusteella korvataan osa lääkärin palkkioista, lääkärin määräämästä hoidosta ja tutkimuksista sekä sairausvakuutusta varten kirjoitetuista lääkärintodistuksista. Korvaukset eivät koske julkisin varoin kustannettua terveydenhuoltoa. Korvaus lääkärinpalkkioista on 60 % Kelan taksojen mukaisista kustannuksista. Hoidosta ja tutkimuksista korvaus on 75 % Kelan taksojen mukaisista kustannuksista omavastuun ylittävältä osalta.
(Päivitetty 12.5.2009)